由上可知， 九天玄女為上古之神女，俗稱 九天娘娘、九天玄姆，或簡稱玄女，為黃帝之仙師。

相傳大約五千年前，黃河流域中下游分佈著許多部落，比較重要的有炎帝部落、黃帝部落等。黃帝，姓姬(或云公孫)，號軒轅氏、有熊氏，原居於西北，後遷徙至涿鹿(今河北涿鹿東南)一帶。跟黃帝同時的另一個部落首領叫做炎帝，最早住在我國西北方姜水附近。據說跟黃帝族是近親。炎帝傳為神農氏後裔，姜姓，號烈山氏或厲山氏。此時，有一個九黎族的首領名叫蚩尤十分強悍，亦為諸侯部落之一。傳說蚩尤有八十一個兄弟，他們全是猛獸的身體，銅頭鐵額，吃的是沙石，兇猛無比。其中蚩尤生得銅頭鐵額，智勇過人，好兵喜亂，機詐百出，不食五穀，作五虛之形，以害黎民。他們還製造刀戟弓弩各種各樣的兵器，常常帶領他的部落，侵掠別的部落。

有一次，蚩尤侵佔了炎帝的地方，炎帝起兵抵抗，不敵對手，被蚩尤攻破。炎帝沒法子，逃到涿鹿請求黃帝幫助。黃帝亦深明蚩尤之禍害百姓，便聯合統帥炎帝等部落，在涿鹿的田野上和蚩尤展開一場大決戰。蚩尤對法術略知一二，作法施展，引聚濃霧，使黃帝之大軍，身陷五里霧中，無法分辨方向，遂而一一戰敗，血流成河，死傷慘重。蚩尤兇殘，難以降服，非求天助，難以成也。故而黃帝虔設香案，禱叩於天，是夜神應，有一女仙從天而降，乃九天玄女是也。玄女賜以神符遁甲、陰陽步斗之術，並傳授製作指南車之法，使帝軍得以辨識方向，一挽頹勢，最後終得戰勝敵軍，擒殺蚩尤，撫平亂源，大定四方。涿鹿之戰後，黃帝受到了許多部落的擁護。後來炎帝族和黃帝族也發生了衝突，雙方在阪泉（今河北涿鹿縣東南）地方打了一仗，炎帝失敗。從此，中原各部落咸尊黃帝為共主，炎、黃等部落在黃帝的領導下融合成華夏民族。中華民族素自承為「黃帝後裔」，又因炎、黃兩部落融合成華夏民族，故稱為「炎黃子孫」。

自黃帝滅蚩尤後， 九天玄女護佑明主之使命完成，便乘丹鳳率徒返天，黃帝為感念其護國解危之恩，下詔封誥 九天玄女為「太玄國師 護國保帝 九天玄女元君」，其遺跡在今陝西省黃帝陵，應有蹤跡可尋。由於 九天玄女受封為開國仙師，故自黃帝立國以來，在祈天祭典，皆立有國師 「九天玄女」神位，代代延傳。歷代皇帝受 九天玄女庇佑感應者，時有所聞。於楊貴妃傳記中，唐明皇失蹤，楊貴妃祈求 九天玄女保佑皇帝平安，其有來自。 九天玄女娘娘以斯之故，其深宏願力之一，在於護國保帝，是以每逢改朝換代，戰燹水火之時， 娘娘勢必顯化，應世救民。又因 娘娘下世傳授黃帝治國兵符之法，遂被世人尊稱為萬法教主，此於歷史亦見記載，非虛誣也！羅列如下：

宋朝名將岳飛在《諸葛武侯行兵遁甲金函玉鏡圖序》提到：「上古聖皇軒轅氏破蚩尤不勝，齋禮上感 九天玄女傳授驅役六丁玉女之神。諸遁甲旬內逐日遁時，書為八門，而孔明得之於龍門山巖穴之間，孔明行師出陣，用於取戰魏吳諸將，咸稱其神焉。」

明朝名軍師劉伯溫在《奇門遁甲》總序中如此提到：「竊推黃帝戰蚩尤於涿鹿，夢天神授神符，而命風后演就《遁甲》，此遁甲所由始也。帝堯命大禹治水，得 玄女傳文，而因洛龜書敘九疇，此《遁甲》所由著也。漢 子房總局十八而成決勝之功。蜀 孔明分列三奇而創艱難之業。」